Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms