Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNAL1Q9UBT7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms