Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGAP28Q9P2N2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARHGAP28Q9P2N2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms