Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP4Q9P0V3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP4Q9P0V3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4Q9P0V3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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