Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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HOXC10Q9NYD6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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HOXC10Q9NYD6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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HOXC10Q9NYD6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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HOXC10Q9NYD6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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HOXC10Q9NYD6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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HOXC10Q9NYD6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC10Q9NYD6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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