Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMSN1Q9NSI8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMSN1Q9NSI8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms