Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCC13Q9NSE7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms