Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms