Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRCC1Q9C099 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRCC1Q9C099 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms