Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5DQ9BY66 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms