Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCP2Q9BX26 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms