Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms