Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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