Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF4Q96M43 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms