Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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