Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC97Q96F63 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms