Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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UBE2E3Q969T4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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UBE2E3Q969T4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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UBE2E3Q969T4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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UBE2E3Q969T4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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UBE2E3Q969T4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE2E3Q969T4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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