Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFKQ969G6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms