Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC9Q8TBE3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms