Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms