Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CNNM3Q8NE01 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CNNM3Q8NE01 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CNNM3Q8NE01 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CNNM3Q8NE01 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CNNM3Q8NE01 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CNNM3Q8NE01 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CNNM3Q8NE01 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CNNM3Q8NE01 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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