Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms