Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms