Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms