Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms