Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
WDR53Q7Z5U6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms