Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SCXQ7RTU7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SCXQ7RTU7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms