Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD2Q6P5Q4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms