Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms