Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL2Q6F5E8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms