Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF123Q5XPI4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms