Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms