Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms