Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms