Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms