Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms