Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms