Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSRP2Q16527 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms