Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SCN9AQ15858 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SCN9AQ15858 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCN9AQ15858 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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