Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA2Q15822 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA2Q15822 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA2Q15822 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA2Q15822 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA2Q15822 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA2Q15822 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms