Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms