Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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