Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms