Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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SEMA3AQ14563 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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SEMA3AQ14563 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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SEMA3AQ14563 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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SEMA3AQ14563 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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SEMA3AQ14563 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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SEMA3AQ14563 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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