Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNTB1Q13884 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNTB1Q13884 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNTB1Q13884 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNTB1Q13884 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNTB1Q13884 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SNTB1Q13884 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNTB1Q13884 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms