Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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