Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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