Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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