Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SKP2Q13309 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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SKP2Q13309 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SKP2Q13309 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKP2Q13309 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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