Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRDNQ13061 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRDNQ13061 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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